Por cientificação da autonomia entendemos o processo de construção da Autonomia através do conhecimento, fazendo da Universidade dos Açores o polo do seu desenvolvimento, com ramificações sobretudo nos sistemas teóricos de e da Autonomia, nos sistemas constitucionais e estatutários, nos sistemas de construção do Direito Regional, da Administração Pública, das relações Europeias e Internacionais.