Por Governo das ilhas é necessário certo cuidado: tanto é possível referir-se aos órgãos próprios, a Assembleia legislativa e Governo regional, como também referir-se, em conjunto, aos órgãos do Estado, Representante da República e Presidente da República que, não sendo órgãos autonómicos, pertencem ao sistema autonómico. Além disso, e mais incisivamente em termos práticos, pode referir–se à administração governativa regional e estadual através da participação, direta e indireta, do Governo da República.
